根据刚刚收到的北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》2011年版编委会的通知，依据文献计量学的原理和方法，经研究人员对相关文献的检索、计算和分析，以及学科专家评审，南海水产研究所主办的《南方水产》（改名为《南方水产科学》）入编《中文核心期刊要目总览》2011年版（即第六版）之水产、渔业类的核心期刊。这是《南方水产》自2005年创刊以来首次入选中文核心期刊，也是继2008年成为中国科技论文统计源期刊、2011年成为RCCSE中国核心学术期刊后的又一个重要里程碑，标志着期刊的办刊质量和学术水平又迈上了新台阶，实现了新的跨越。

由北京大学图书馆牵头编制的《中文核心期刊要目总览》是目前国内较权威的核心期刊工具，应用相当广泛。2011年版《中文核心期刊要目总览》对核心期刊的评价仍采用定量评价和定性评审相结合的方法。采用了被索量、被摘量、被引量、他引量、被摘率、影响因子、被国内外重要检索工具收录、基金论文比、Web下载量等9个定量评价指标，选作评价指标统计源的数据库及文摘刊物达到60余种，涉及期刊14400余种。参加核心期刊评审的学科专家达8200多位。经过定量筛选和专家定性评审，从我国正在出版的中文期刊中评选出1982种核心期刊。

近年来，《南方水产》始终坚持以提高学术质量和学术影响力作为期刊发展的方向，紧密围绕服务于我国水产科研和学科建设，突出地方特色和专业优势，多项评价指标连年上升。入选中文核心期刊，是对《南方水产》学术水平和影响力的极大肯定，也标志着南海所科研水平有了大幅提升，对一流研究所的建设具有重要而深远的意义。